آیت الله دکتر محمد مفتح همراه با دو پاسدار محافظ خود، هنگام ورود به دانشکده الهیات در یک عملیات تروریستی توسط عوامل گروه فرقان ترور شد و به شهادت رسید. به همین مناسبت 27 آذر روز وحدت حوزه و دانشگاه نام گرفت.
در ۲۷ آذر ماه سال ۱۳۵۸ آیت الله دکتر محمد مفتح از روحانیون روشنفکر و فعالان نهضت امام خمینی (ره) در پیروزی انقلاب اسلامی و عضو شورای انقلاب، هنگام ورود به دانشکده الهیات دانشگاه تهران توسط گروهک فرقان با شلیک چند گلوله به شهادت رسید.
پیکر شهید آیت الله محمد مفتح و دو پاسدار شهید، در ۲۸ آذر ماه سال ۱۳۵۸ با حضور ده ها هزار نفر از اقشار مختلف مردم از مقابل مسجد دانشگاه تهران تا لانه جاسوسی آمریکا تشییع شد
